【HIV病毒君的海派Freestyle】
HIV病毒如何分类?
根据血清学反应(检测的是HIV的抗体类型)和核酸序列测定(检测的是HIV的基因序列),我有两种类型:HIV-1型和HIV-2型。这两种类型的核苷酸序列的同源性仅为45%(说人话就是两种类型的遗传物质的一致性只有45%),差别这么大,难怪我和我的亲戚会对面相逢不相识了。
HIV- 1型最先被发现,人推断HIV-1来源于黑猩猩,它毒性大,感染性强,流行性大,全球的艾滋病均主要由感染HIV-1引起。人推断HIV-2来源于白眉猴,它的毒性较小,感染性较低,流行性较小,目前仅在西非流行,即我们国家是没有HIV-2的,大伙不用担心。不懂HIV-2这个兄弟为什么这么热爱西非,回头问问它是不是在西非有什么小目标要实现。
HIV-1型病毒如何分类?
根据编码包膜蛋白的env基因和编码壳蛋白的gag基因序列的同源性(同源性即相似程度),人进一步将HIV-1分为三组:主要组(Main,M)、外围组(Outline,O)和新组(New,N)(新组就是主要组和外围组之外的类型组成的组)。
目前全球已鉴定的HIV-1绝大多数是M组,可分为A-J10个亚型,具体说来是9种亚型(subtypes)和14种流行重组形式(CRFs)。O组(outline,外围组),从喀麦隆和加蓬分离得到,与M组其他亚型的氨基酸序列的同源性仅为50%。N组(new),从两名喀麦隆病人分离得到,既不属于M组,也不属于O组。
在HIV-1型内,各亚型之间都是基因离散率是20%~35%(基因离散率可以理解为母代基因和子代基因的差异率,越大差异越大),同一亚型内的基因离散率是7%~20%。这下知道为什么HIV的疫苗那么难研制了吧,因为科学家的计划赶不上病毒君我的变化,话说连我都不一定认得出我那些子孙后代。
流行重组形式科普:
所谓流行重组形式,就是与亚型属于同一分类等级,含不同亚型镶嵌基因且具流行意义的重组株。CRF01-AE是第1个通过全长基因序列鉴定的CRFs,是A亚型和一种尚未鉴定的U(表示未分类区段)亚型的重组,数字表示发现顺序,字母表示其亲代亚型,或用cpx表示其含有≥3个不同亚型基因重组。
HIV的传播与分型
目前,HIV-1 型的CRF01_AE、CRF07_BC重组型、以及B'亚型是中国流行最广泛的毒株。中国早期主要流行M组中的B'亚型和C亚型,2007年后M组的CRF01_AE重组型成为我国优势毒株,同时兼有流行一定比例的CRF07_BC重组型、CRF08_BC重组型和B'亚型。总体说来,A亚型的传播率最高,A亚型比C和D亚型高,E亚型高于B亚型。
性传播途径是我的主要传播途径,MSM-男男性接触者易感染B亚型,关于MSM,研究表明感染CRF01_AE重组型的感染者的CD4比感染CRF07_BC重组型下降更快。异性性接触易感染B亚型、A亚型、CRF01-AE重组型和C亚型。注射者(IDUs)易感染B亚型或B/F重组株(F亚型主要是因感染的产品和未消毒的针头和针筒而感染)。